La localización estratégica de la Eurorregión en el sur peninsular y europeo, y su situación respecto de las grandes áreas metropolitanas (Madrid y Lisboa), así como su disposición entre las fachadas atlántica y mediterránea que le permite servir de puente entre continentes (Europa, Africa, América, Asia), confiere a la Eurorregión Alentejo-Algarve-Andalucía una posición privilegiada en el marco de la nueva Estrategia Territorial Europea.  

Con una superficie de 120 000 km2, ocupa el 21% de la superficie de la península ibérica y despliega una enorme diversidad físico-natural: extenso litoral de 1 500 kilómetros en el que se combinan playas, calas y acantilados, frondosas sierras de media montaña, amplias depresiones y valles articulados en torno a las dos grandes redes hidrográficas Guadalquivir-Guadiana; y paisajes singulares como los desiertos de Almería o las altas cumbres de Sierra Nevada.