Os principais resultados esperados do Projeto VALAGUA são: i) a integração dos aspetos qualitativos e quantitativos de gestão da água entre os seus principais utilizadores nos dois lados da bacia do Guadiana, ii) a integração dessa gestão transfronteiriça da água com a conservação dos ecossistemas ribeirinhos, iii) a valorização ecoturística dos recursos associados, e iv) a gestão integrada da água e da biodiversidade por parte dos principais atores e decisores nos territórios contíguos da Rede Natura 2000 do Baixo Guadiana.